Tuy chưa phát triển ồ ạt, nhưng tình trạng ô nhiễm đã xuất hiện nhiều nơi. Thảm cỏ biển, các bãi san hô đang bị xâm lấn hàng ngày do hoạt động cào xới tìm hải mã, hải long, hải sản để cung cấp cho các nhà hàng.

Chất thải rắn từ sinh hoạt, vỏ sò, vỏ ốc được chất thành đống hay đổ xuống các vịnh quanh đảo. Nước thải đủ loại từ khách sạn, resort và các khu dân cư đều đổ ra biển không qua xử lý.
Với tình trạng trên, không bao lâu nữa, biển Phú Quốc sẽ bị ô nhiễm nặng nề trước khi có khả năng tiếp đón hàng triệu khách du lịch.
Ngay từ hôm nay, Phú Quốc rất cần xây dựng một chiến lược bảo vệ môi trường thật nghiêm khắc. Tất cả hoạt động kinh tế- xã hội trên đảo phải tuân theo phương châm “sử dụng và khai thác” đi cùng “gìn giữ và tái tạo”.Những bài học về ô nhiễm môi trường biển của Hạ Long và Cát Bà đủ để cảnh tỉnh Phú Quốc.
Phát triển Phú Quốc trở thành trung tâm du lịch, giao thương quốc tế, để toả sáng như viên ngọc bích trên vùng biển Tây Nam. Đó là một kỳ vọng lớn đứng trước một cơ hội lớn.
Tuy nhiên, đây cũng là nhiệm vụ cần đến sự nỗ lực phi thường để huy động vốn đầu tư trong và ngoài nước, cũng như sự chỉ đạo thống nhất và đồng bộ từ Trung ương đến địa phương.
Phát triển Phú Quốc trở thành trung tâm du lịch, giao thương quốc tế, để toả sáng như viên ngọc bích trên vùng biển Tây Nam. Đó là một kỳ vọng lớn đứng trước một cơ hội lớn.
Tuy nhiên, đây cũng là nhiệm vụ cần đến sự nỗ lực phi thường để huy động vốn đầu tư trong và ngoài nước, cũng như sự chỉ đạo thống nhất và đồng bộ từ Trung ương đến địa phương.